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肿瘤
此项研究 2 月 2 日在线发表在 cell 上，题为 “Gene Essentiality Profiling Reveals Gene Networks and SyntheticLethal Interactions with Oncogenic Ras” 。
研究的重要内容集中在和癌基因 Ras 相关的基因和蛋白通路。Ras 是在急性髓系白血病和其它人类癌症中，最普遍的突变癌基因。文章的第一作者 Tim Wang 解释：“在大多数情况下，突变的 Ras 蛋白本身被认为是‘无药可治’的。另外一种方法是找到 Ras 突变的癌症的其它基因，希望它们能用药物治疗。这样的‘Ras 合成致死’基因之前是非常难以辨别的。”
基于 CRISPR 基因编辑技术，研究人员可以测量单独敲除 18000 个人类基因组蛋白质编码基因的影响。通过比较 Ras 依赖型和非依赖型的细胞系发现了致癌基因 Ras 的合成致死伙伴基因。通讯作者 David Sabatini 解释说：“这个过程能够让我们很快地确认在 Ras 突变细胞中选择性需要的基因名单。我们认为这种通用的方法可以在很多癌症的类型中发现漏洞。”
除了定义 Ras 特定基因的必要性网络，这项研究提供的数据也可以让研究人员破译先前未研究的基因的分子功能。他们从一些在某些细胞系中是必需的但在其它细胞系中可有可无的基因出发。对于每一个这样的基因，研究者通过筛选数据来找到其它有类似功能的、匹配模式中的必要性基因。事实上，这个类似于 “犯罪关联性” 的分析揭示了现在已知的、在一起起作用的基因群体，还发现了一些基因之间以前不知道的或未被研究过的新联系。
Wang 总结说：“这项工作最令人兴奋的是，我们刚刚开始用我们的方法来进行初步的探索。通过广泛的应用，我们可以揭示有关人类基因功能性组织的大量信息，以及它们在很多疾病中的作用。”
Gene Essentiality Profiling Reveals Gene Networks and SyntheticLethal Interactions with Oncogenic Ras.
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